在膜支撐的芯片試驗中,納米修飾的鉻金屬線(10 nm高100 nm款)將獲支撐的雙層膜分割成微米級別的圍欄,從而將SOS分子激活的Ras蛋白包圍進來。
揭示活細胞反應(yīng)過程以及細胞如何響應(yīng)化學信號的機制將有助于改進當下針對已產(chǎn)生抗性的多種癌癥和其他細胞紊亂疾病的治療方法。ELISA試劑盒一個由美國能源部(DOE)伯克利國立研究所(Berkeley Lab)和加利福尼亞大學伯克利分校的研究小組研究揭示了Ras蛋白家族活性機制。這一蛋白家族是細胞生物信號網(wǎng)絡(luò)的zui重要組成部分之一,也是癌癥發(fā)展主要驅(qū)動因素。該研究成果7月3日刊載在Science期刊上。
活細胞的細胞信號網(wǎng)絡(luò)起始于位于細胞表面的受體蛋白,由這些蛋白檢測并與環(huán)境中的信號作用,之后受體將接受到的信號轉(zhuǎn)化為化學網(wǎng)絡(luò)。盡管胞內(nèi)信號網(wǎng)絡(luò)執(zhí)行的邏輯運算類似計算機微處理器,然而又有不同之處,即同樣的輸入會產(chǎn)生不一樣的結(jié)果。Ras是膜錨定蛋白家族一員,其活性的激活是細胞信號傳導(dǎo)中關(guān)鍵步驟,其控制胞內(nèi)細胞增殖、分化和存活。已知Ras基因的變異是*發(fā)現(xiàn)的與人類癌癥相關(guān)的變異,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)約1/3的癌癥發(fā)生了Ras的錯誤激活現(xiàn)象。同時Ras信號的不正常也被認為是其他疾病例如糖尿病、免疫相關(guān)疾病和炎癥紊亂等的致病因子。理解Ras信號作用的阻力在于如何通過SOS交換因子(exchange factors)激活膜錨定蛋白Ras的重要作用,而SOS活性又通過該蛋白和膜的相互作用調(diào)節(jié)構(gòu)象。這一相互關(guān)系的認識當前是通過細胞生物學研究推斷出來而非直接觀察的結(jié)果。為更好理解通過SOS調(diào)控Ras活性的機制,研究人員需要在膜上直接觀察每個SOS分析與Ras的作用。然后,從膜環(huán)境來研究歷來一直是個挑戰(zhàn)。
此次研究,研究人員使用了膜支撐的芯片平臺。研究人員通過固定模式組裝金屬納米結(jié)構(gòu),并置入二氧化硅基質(zhì)中,從而形成脂質(zhì)層,而膜芯片由這種脂質(zhì)層構(gòu)建而成。這種金屬結(jié)構(gòu)允許胞膜蛋白以一定間距排列在膜上,從而可以在類似芯片平臺的膜上實時觀察某個蛋白。ELISA試劑盒在此次研究過程中,這一獲得支撐的膜使得研究人員可以捕捉每個SOS分子,從而觀察其激活的膜相關(guān)Ras蛋白的活動,從分子層面對膜環(huán)境的Ras活性進行研究。
該研究證實SOS蛋白(Son of Sevenless)激活 Ras信號的機制。此前認為,活細胞中Ras的激活涉及一些SOS分子,從而使得每個分子的多樣化行為得到平均(average)。這一突變被認為是一種隨機的“噪點”,研究人員多數(shù)認為這是細胞必須克服的一個錯誤。而此次研究顯示,該蛋白隨著活性傳輸信息而在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)換動態(tài),這意味著研究人員發(fā)現(xiàn)了蛋白信號反應(yīng)的動態(tài)耦合*基于動力學,而不是信號被平均(average)的結(jié)果。該研究發(fā)現(xiàn),SOS根據(jù)不同活性狀態(tài),基于*的隨機波動動力學(the dynamics of distinct stochastic fluctuations)來實現(xiàn)其調(diào)控作用,而這一現(xiàn)象在集成平均化(ensemble averages)的過程中是無法體現(xiàn)的。這一長期波動解釋了變構(gòu)SOS調(diào)控和Ras激活的機制。
揭示Ras蛋白信號傳導(dǎo)機制中的隨機動力學變化有利于找到治療Ras導(dǎo)致的癌癥和其他細胞紊亂疾病的新型療法。ELISA試劑盒實際上,研究人員認為這一機制的揭示對于很多其他胞內(nèi)信號蛋白的機制的研究也具有啟發(fā)作用。
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